總公司和分公司在同一地且同一管轄區(qū)的情況下，可以由總公司統(tǒng)一報(bào)稅，如果不在同一地區(qū)，那么按照屬地原則，分公司要單獨(dú)在其所在地進(jìn)行申報(bào)的。
1、稅務(wù)登記等。要在領(lǐng)取營業(yè)執(zhí)照后30日內(nèi)辦理稅務(wù)登記。
是否國地稅都要辦，視乎你的企業(yè)所得稅是國稅征收還是地稅征收：如果是國稅收，則國地稅都要辦;如果地稅征收，則還要看經(jīng)營項(xiàng)目，如果是營業(yè)稅為主稅種，則只辦地稅，如果增值稅為主稅種，則國地稅都要辦。
2、申報(bào)納稅。視乎稅種。
營業(yè)稅在勞務(wù)發(fā)生地繳稅;企業(yè)所得稅由總機(jī)構(gòu)匯總申報(bào);代扣繳個人所得稅由支付工薪的機(jī)構(gòu)代扣繳。
3、現(xiàn)在稅務(wù)上也不大管你是否獨(dú)立核算，該匯總繳納的(企業(yè)所得稅)都要匯總繳納，該就地繳納的(營業(yè)稅)都要就地繳納。可以就地繳納也可以匯總繳納的(個人所得稅)，沒經(jīng)過審批，也就地繳納。
4、建賬問題：分公司和總公司可以采取兩種方式核算：
(1)一是獨(dú)立核算，也就是單獨(dú)建賬，對分公司的業(yè)務(wù)經(jīng)營活動過程及其成果進(jìn)行全面、系統(tǒng)的會計(jì)核算。
特點(diǎn)是：在管理上有獨(dú)立的組織形式，具有一定數(shù)量的資金，在當(dāng)?shù)劂y行開戶;獨(dú)立進(jìn)行經(jīng)營活動，能同其他單位訂立經(jīng)濟(jì)合同;獨(dú)立計(jì)算盈虧，單獨(dú)設(shè)置會計(jì)機(jī)構(gòu)并配備會計(jì)人員，并有完整的會計(jì)工作組織體系;
(2)二是非獨(dú)立核算，非獨(dú)立核算又稱報(bào)賬制，是把本單位的業(yè)務(wù)經(jīng)營活動有關(guān)的日常業(yè)務(wù)資料，逐日或定期報(bào)送上級單位，由上級單位進(jìn)行核算。特點(diǎn)是一般由上級拔給一定數(shù)額的周轉(zhuǎn)金，從事業(yè)務(wù)活動，一切收入全面上繳，所有支出向上級報(bào)銷，本身不單獨(dú)計(jì)算盈虧，只記錄和計(jì)算幾個主要指標(biāo)，進(jìn)行簡易核算。
5、申報(bào)問題：總公司和分公司在同一地且同一管轄區(qū)的情況下，可以由總公司統(tǒng)一報(bào)稅，如果不在同一地區(qū)，那么按照屬地原則，分公司要單獨(dú)在其所在地進(jìn)行申報(bào)的。
分公司與總公司的關(guān)系體現(xiàn)在以下幾個方面：
(1)分公司沒有自己的獨(dú)立財(cái)產(chǎn)，其實(shí)際占有、使用的財(cái)產(chǎn)是總公司財(cái)產(chǎn)的一部分，列入總公司的資產(chǎn)負(fù)債表。
(2)分公司不具有法人資格，不獨(dú)立承擔(dān)民事責(zé)任。
(3)分公司的設(shè)立程序與一般意義上的公司設(shè)立程序不同，設(shè)立分公司只需辦理簡單的登記和開業(yè)手續(xù)。
(4)分公司沒有自己的公司章程，沒有董事會等公司經(jīng)營決策機(jī)構(gòu)。
(5)分公司名稱為總公司名稱后加分公司字樣，其名稱中雖有公司字樣，但不是真正意義上的公司。分公司不具有法人資格，不獨(dú)立承擔(dān)民事責(zé)任。
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