關(guān)于借款合同印花稅，以下12種特殊情形需要注意。
1、以填開借據(jù)方式取得銀行借款的借據(jù)。
目前，各地銀行辦理信貸業(yè)務(wù)的手續(xù)不夠統(tǒng)一，有的只簽訂合同，有的只填開借據(jù)，也有的既簽訂合同又填開借據(jù)。為此規(guī)定：凡一項信貸業(yè)務(wù)既簽訂借款合同又一次或分次填開借據(jù)的，只就借款合同按所載借款金額計稅貼花；凡只填開借據(jù)并作為合同使用的，應(yīng)按照借據(jù)所載借款金額計稅，在借據(jù)上貼花。
2、對流動資金周轉(zhuǎn)性借款合同的貼花。
借貸雙方簽訂的流動資金周轉(zhuǎn)性借款合同，一般按年（期）簽訂，規(guī)定最高限額，借款人在規(guī)定的期限和最高限額內(nèi)隨借隨還。為此，在簽訂流動資金周轉(zhuǎn)借款合同時，應(yīng)按合同規(guī)定的最高借款限額計稅貼花。以后，只要在限額內(nèi)隨借隨還，不再簽新合同的，就不另貼印花。
3、關(guān)于對抵押貸款合同。
借款方以財產(chǎn)作抵押，與貸款方簽訂的抵押借款合同，屬于資金信貸業(yè)務(wù)，借貸雙方應(yīng)按“借款合同”計稅貼花。因借款方無力償還借款而將抵押財產(chǎn)轉(zhuǎn)移給貸款方，應(yīng)就雙方書立的產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)移書據(jù)，按“產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)移書據(jù)”計稅貼花。
4、關(guān)于對融資租賃合同。
銀行及其金融機構(gòu)經(jīng)營的融資租賃業(yè)務(wù)，是一種以融物方式達到融資目的的業(yè)務(wù)，實際上是分期償還的固定資金借款。因此，對融資租賃合同，可據(jù)合同所載的租金總額暫按“借款合同”計稅貼花。
5、關(guān)于借款合同中既有應(yīng)稅金額又有免稅金額。
有些借款合同，借款總額中既有應(yīng)免稅的金額，也有應(yīng)納稅的金額。對這類“混合”借款合同，凡合同中能劃分免稅金額與應(yīng)稅金額的，只就應(yīng)稅金額計稅貼花；不能劃分清楚的，應(yīng)按借款總金額計稅貼花。
6、借款方與銀團“多頭”簽訂借款合同。
在有的信貸業(yè)務(wù)中，貸方是由若干銀行組成的銀團，銀團各方均承擔(dān)一定的貸款數(shù)額，借款合同由借款方與銀團各方共同書立，各執(zhí)一份合同正本。對這類借款合同，借款方與貸款銀團各方應(yīng)分別在所執(zhí)合同正本上按各自的借貸金額計稅貼花。
7、對基建貸款中，先簽訂分合同，后簽訂總合同。
有些基本建設(shè)貸款，先按年度用款計劃分年簽訂借款分合同，在最后一年按總概算簽訂借款總合同，總合同的借款金額中包括各分合同的借款金額。對這類基建借款合同，應(yīng)按分合同分別貼花，最后簽訂的總合同，只就借款總額扣除分合同借款金額后的余額計稅貼花。
8、與金融機構(gòu)簽訂的借款展期合同。
經(jīng)過協(xié)商僅延長借款合同還款期限簽訂的借款展期合同，根據(jù)國稅發(fā)[1991]155號第七條規(guī)定，暫不貼花。
9、與金融機構(gòu)簽訂的委托貸款合同。
委托單位與銀行簽訂的委托貸款合同，根據(jù)國稅發(fā)[1991]155號第六條和第十四條的規(guī)定：在代理業(yè)務(wù)中，代理單位與委托單位之間簽訂的委托代理合同，凡僅明確代理事項、權(quán)限和責(zé)任的，不需印花。
10、與金融機構(gòu)簽訂的授信合同。
企業(yè)與銀行簽訂的授信額度協(xié)議，根據(jù)《商業(yè)銀行授權(quán)、授信管理暫行辦法》第十條第四款，是銀行對借款人在一定期間內(nèi)允許融資的額度計劃，與“借款合同”有區(qū)別，不需貼花。
11、保理合同。
保理又稱托收保付，出口商將其現(xiàn)在或?qū)淼幕谄渑c買方訂立的貨物銷售或服務(wù)合同所產(chǎn)生的應(yīng)收賬款轉(zhuǎn)讓給保理商（提供保理服務(wù)的金融機構(gòu)），由保理商向其提供資金融通、進口商資信評估、銷售賬戶管理、信用風(fēng)險擔(dān)保、賬款催收等一系列服務(wù)的綜合金融服務(wù)方式。保理合同雖然具有融資性質(zhì)，但不屬于借款，不需貼花。
12、貼現(xiàn)合同。
企業(yè)辦理匯票貼現(xiàn)，提前獲得資金，將票據(jù)轉(zhuǎn)移給銀行，銀行扣除貼現(xiàn)利息，是否繳印花稅有爭議。
《安徽省淮北市地方稅務(wù)局關(guān)于明確票據(jù)貼現(xiàn)合同是否繳納印花稅的通知》（淮地稅函[2003]143號）中規(guī)定，“所謂貼現(xiàn)，是指票持有人在票據(jù)到期前,為獲取現(xiàn)款而向貼現(xiàn)機構(gòu)貼付一定利息所作的票據(jù)轉(zhuǎn)讓業(yè)務(wù)。因此，貼現(xiàn)業(yè)務(wù)不屬于借貸行為。貼現(xiàn)合同不屬于《條例》所列舉的合同范圍，故不貼花?！?br>
《山東省地方稅務(wù)局關(guān)于票據(jù)貼現(xiàn)業(yè)務(wù)征收印花稅問題的批復(fù)》（魯?shù)囟惡痆2005]30號）中認(rèn)為，“企業(yè)與銀行間的票據(jù)貼現(xiàn)業(yè)務(wù)是持票人為獲得資金，將未到期的商業(yè)匯票轉(zhuǎn)讓給銀行，由銀行扣除一定利息后收取剩余票款的業(yè)務(wù)活動，其實質(zhì)是一種短期借款，應(yīng)按借款合同征收印花稅，其計稅依據(jù)為票據(jù)到期值（不帶息票據(jù)為票據(jù)面值）。”不過該《批復(fù)》已經(jīng)于2013年10月31日廢止。